Más allá de la ciudad de Torchlight se encuentra un mundo envuelto en la aventura y el misterio. Un descubrimiento revela que el alquimista, después de su conquista al Dark Ember, desapareció en su búsqueda para derrotar a la fuerza corrupta desconocida responsable de la destrucción de la raza mística de Estherians. Ayudado por Syl, los Guardianes Estherian restantes, y las pistas dejadas por el alquimista, se encontrará luchando contra un poderoso enemigo que amenaza con deshacer los elementos de todo el mundo.