Apropiado para los jugadores nuevos en la serie y veteranos por igual, el modo historia ofrece a los jugadores cinco personajes pre-hechos, cada uno con su propia personalidad y el diálogo para explorar un lado de Etria no se ve en el primer juego. Los aventureros deben enfrentarse a nuevos diseños de las mazmorras y enemigos para averiguar la verdad del árbol Yggdrasil y la chica misteriosa, Frederica.